Марвел: начиная с Верховного Мага повествует о человеке, который возрождается во Вселенной Марвел и начинает новую жизнь в Камар-тадже — волшебном святилище, скрытом среди обычного города. Главный герой быстро осваивает магию, ежедневно регистрируясь, чтобы получать новые магические способности. Вскоре его неожиданно назначают Верховным Магом, что подразумевает большие обязанности и ответственность. Это назначение происходит по инициативе старой могущественной наставницы по имени Древняя, которая сама занимает этот титул до передачи полномочий. Главный герой не испытывает особого энтузиазма по поводу роли защитника Земли или участника борьбы за справедливость, что создаёт внутренний конфликт между его желаниями и возложенными обязанностями. Развитие сюжета связано с его попытками понять сущность своей новой роли и необходимость противостоять угрозам, исходящим из мистического и сверхъестественного мира, который тесно переплетается с реальностью.

Вокруг него формируются отношения с другими магами и могущественными фигурами, среди которых есть как соратники, так и враги. Главный герой сталкивается с испытаниями, которые предъявляют ему высокие требования силы и мудрости, а также вызывают сомнения и необходимость принимать трудные решения. Его действия и выборы влияют на баланс сил в Камар-тадже и шире — во Вселенной Марвел, где темные и светлые силы стремятся заявить о себе. История охватывает не только магические сражения и приключения, но и аспекты повседневной жизни, юмор и мистику, что отражает многогранность положения героя и его окружения. В итоге сюжет фокусируется на поиске собственного пути Верховного Мага, который вынужден совмещать личные взгляды с обязанностями защитника мира от сверхъестественных опасностей.