Марвел: Железная воля представляет собой историю, в которой главный герой, Тони Старк, после катастрофического события, известного как Щелчок, возвращается в прошлое с целью изменить ход событий. Он ставит перед собой задачу избежать прежних ошибок и добиться, чтобы все силы объединились в противостоянии общей угрозе — Таносу. Тони Старк понимает, что для достижения этой цели ему придется действовать решительно и возможно даже взять под контроль мир, чтобы убедиться в единстве и эффективности усилий. Исходным положением служит осознание им того, что прежние попытки оказались неудачными и привели к серьезным последствиям. Запуском развития сюжета становится сама возможность вернуться назад и исправить ошибки, что вызывает цепь событий, связанных с его решимостью и методами.

В процессе он сталкивается с серьезными препятствиями, в том числе необходимостью выстраивать сложные отношения с разными людьми и справляться с внутренними и внешними конфликтами, порожденными его решением действовать максимально жёстко. Это приводит к необходимости принимать трудные решения, балансировать между личными убеждениями и глобальными целями. Сюжет развивается в рамках сочетания боевых действий, научно-фантастических элементов, романтических и комедийных моментов, а также приключенческих и триллерных событий. Всё это формирует напряженную и многогранную обстановку, в которой главная задача Тони — не подвести ни себя, ни тех, кто надеется на его успех. Основной конфликт строится вокруг противостояния с Таносом и внутренней борьбой героя с необходимостью идти на крайние меры ради достижения цели.