Армия сверхбожных машин повествует о Цзян Ли, который неожиданно оказывается в фантастическом мире вместе с игрой под названием Super Godly Machine Army. Вместе с перемещением в новый мир у Цзян Ли появляется доступ к специальному интерфейсу под названием Панель Доминатора, через который он управляет различными воинскими частями, включая пехотную механическую часть, военно-морской флот, воздушные войска, космические машины и спецназ. Изначально герой располагает нулевым количеством очков энергии и искр души, необходимых для создания и улучшения боевых машин. Цзян Ли начинает создавать разнообразных механических солдат, таких как боевые роботы, машины из жидкого металла, всадников на машинных драконах и солдат силы Пустоты, а также инженеров.

Эти действия являются главными событиями, вызывающими развитие сюжета, поскольку с помощью таких машин герой стремится укрепить свои позиции и справиться с возникающими препятствиями. Основным конфликтом становится необходимость наращивать мощь своей армии для выживания и достижения контроля в необычном мире, где технологии и фантазия сочетаются. Для решения задач Цзян Ли использует очки энергии, получаемые путем преобразования ресурсов мира, и управляет созданием и модернизацией мехов. Таким образом, Цзян Ли последовательно расширяет армию боевых машин, что меняет его положение и влияет на ход событий в окружающем мире.