Блич: Тайные Намерения рассказывает о мальчике по имени Ся Ян, который оказался в мире Блич и стал одиннадцатилетним ребёнком. Его спасают Рэндзи и Рукия, обитатели поселения Сейрейтэй, после чего он начинает обучение в Академии Шин. Ся Ян быстро проявляет себя как лучший ученик академии, что привлекает внимание различных организаций, борющихся за власть.

В связи с этим он сталкивается с многочисленными конфликтами и испытаниями, требующими от него силы и решимости. Чтобы защитить близких и наказать врагов, Ся Ян принимает решение присоединиться к первой команде секретных мобильных войск. Его путь связан с преодолением угроз и соперничеством, а развитие сюжета строится на борьбе за влияние и безопасность в этом новом мире.