Марвел: Сокамерник Дэдпула — это повествование в жанрах боевика, боевых искусств, комедии, приключений, романтики, сверхъестественного и фэнтези. Главный герой, Деррик, оказывается перемещённым во Вселенную Марвел и попадает в ту же лабораторию, что и Уэйд Уилсон, известный как Дэдпул. Проведя несколько месяцев в плену и подвергаясь пыткам, Деррик стремится сбежать. Во время допроса у него появляется системная панель, которая даёт возможность разблокировать специальные титулы и способности при выполнении определённых задач.

С этого момента разворачиваются события, связанные с освоением новых навыков и решением возникающих проблем. Герой сталкивается с необходимостью использовать свои новые возможности, чтобы справиться с угрозами и преодолеть препятствия, которые порождает его положение в чужом мире. Сюжет концентрируется на поисках пути к свободе и на попытках выстоять в суровых условиях, где боевые умения и сверхъестественные силы играют ключевую роль.