Хороший сын, или Происхождение видов рассказывает историю Хана Ючжина, студента юридического факультета, который одновременно является талантливым спортсменом и послушным сыном. Его жизнь резко меняется, когда однажды утром Ючжин просыпается в своей комнате, улавливая характерный металлический запах, а его одежда и постель оказываются испачканными кровью. В кухне он находит тело своей матери с перерезанным горлом. Сам Ючжин не помнит, что произошло прошлой ночью, поскольку уже несколько дней не принимал свои лекарства. Этот пробел в памяти заставляет его сомневаться в собственной версии событий и порождает страх перед возможным обвинением со стороны полиции и старшего брата.

В попытке скрыть случившееся, Ючжин прячет тело матери и тщательно устраняет все следы крови в квартире. Случайно он обнаруживает дневник, который мать вела исключительно для него. Чтение этого дневника и постепенное восстановление памяти о прошедшей ночи становятся отправной точкой для глубоких внутреннеих перемен главного героя. Он начинает осознавать, что тот образ «хорошего сына», в котором жил всю жизнь, может быть иллюзией, и что мать скрывала от него множество тайн....