Последнее пламя среди морских глубин представляет собой мистическую фэнтезийную новеллу с элементами сверхъестественного. Главным героем становится человек, который в один из дней неожиданно становится капитаном загадочного корабля-призрака. В этот же день вокруг него опускается плотный туман, за которым обнаруживается перевёрнутый и разрушенный мир. В этом мире исчез прежний порядок, а в бескрайних морях за пределами цивилизации правят странные видения. Здесь существуют изолированные города-государства и флотилии кораблей, которые бросают вызов морю и таящимся в глубинах опасностям.

Главный герой оказывается в непростой ситуации, так как, несмотря на важность управления судном, никто из окружающих не знает, как это делать. Его задача — разобраться с управлением кораблём и научиться контролировать опасный и загадочный объект. Помимо этого, он сталкивается с угрозами, связанными с переходом в духовный мир через границу реальности, что создаёт дополнительное напряжение и препятствия....