Дни, когда я был помощником генерального директора романа Мэри Сью рассказывает о жизни обычного личного помощника, который работает у властного генерального директора в мире, напоминающем роман с типичным персонажем Мэри Сью. Главный герой сталкивается с нестандартными и порой сложными заданиями, которые ставит перед ним его босс. Исходная ситуация показывает обычного помощника, выполняющего роли, выходящие за рамки привычных обязанностей, что вызывает у него определённые трудности. Сюжет развивается через выполнение различных поручений, при этом герой пытается справиться с неожиданными ситуациями и разобраться в взаимоотношениях между окружающими персонажами.

Основной конфликт связан с необходимостью балансировать между требованиями начальства и собственной способностью решать сложные задачи, иногда с элементами личных и корпоративных интриг. Герой принимает решения, которые помогают ему справляться с необычными обстоятельствами и подчеркивают его постепенное понимание роли, которую он играет в этой жизни. В итоге повествование сосредоточено на жизни помощника, его взаимоотношениях с боссом и вызовах, возникающих в условиях, похожих на события романа.