«Я женился на однокласснице, которую ненавидел» рассказывает о старшекласснике Ходзё Сайто, который заключил брак со своей одноклассницей Сакурамори Аканэ, девушкой, которая долгое время была для него злейшим врагом в школе. Главные герои стремятся скрыть свою необычную семейную ситуацию от сверстников, договорившись не рассказывать одноклассникам о браке, чтобы избежать конфликтов и неловких ситуаций. Несмотря на то, что их совместная жизнь далеко не идеальна и наполнена частыми ссорами, они проводят много времени вместе, постепенно сокращая эмоциональное расстояние между собой.

Из-за вынужденного брака Сайто и Аканэ сталкиваются с трудностями повседневного сосуществования и неумением открыто выражать свои чувства друг к другу. С течением времени Сайто начинает замечать в Аканэ стороны ее характера, которые ранее были для него скрыты, а Аканэ постепенно осознает собственные эмоции и чувства, которые долгое время прятала внутри. Их отношения проходят через этапы недопонимания и споров, что создаёт напряжённую, но вместе с тем знакомую повседневную атмосферу школьной жизни....