Система изобретательницы представляет собой рассказ в жанрах боевика, литрпг, приключений и фэнтези. Главная героиня — сумасшедшая изобретательница, которая по непонятной причине перемещается в другой мир и рождается там младенцем. В самый первый день своей новой жизни она оказывается похищенной другим сумасшедшим ученым. Это событие становится отправной точкой развития сюжета и создает главный конфликт повествования. Изобретательница сталкивается с угрозой, которая исходит от похитителя, однако ситуация неоднозначна — неясно, кто из них злодей, а кто всего лишь жертва обстоятельств. В условиях другого мира и в младенческом теле героине приходится приспосабливаться, искать возможности для выживания и решения своих задач.

Перед ней возникают препятствия, связанные с новым окружением и отношениями с похитителем, которые запускают цепочку событий. Центральной проблемой становится попытка разобраться в роли каждого участника конфликта и найти выход из сложившейся ситуации. Приходится делать выборы между противостоянием и сотрудничеством, а также использовать свои умения для преодоления трудностей. Развитие сюжета отражает процессы адаптации и борьбы за собственную свободу в необычных условиях. Основное внимание уделено переменам, которые происходят с героиней, и вопросам доверия и власти в непривычной обстановке.