Основным движущим событием становится начало игры для Рейджи, открывающее перед ним безграничные возможности развития в виртуальном мире, но одновременно вызывающее необходимость приспосабливаться к новым вызовам и задачам. В процессе он сталкивается с различными препятствиями — от борьбы с монстрами и выполнения квестов до необходимости принимать важные решения, которые влияют на его дальнейший путь в игре. Конфликты заключаются в противостоянии с врагами и сложностях взаимодействия как с искусственными персонажами, так и с другими игроками.

Рейджи постепенно понимает, что игра не просто развлечение, а отдельный мир с собственными правилами и сложностями, где каждое действие имеет последствия для развития персонажа и сюжета. Он учится ориентироваться в новом пространстве, формировать свои навыки и принимать решения, способные повлиять на исход многочисленных испытаний. Таким образом, сюжет строится на сочетании процесса освоения виртуального мира и внутреннего роста героя, а также на взаимодействии с системой, которая предлагает игроку разнообразные пути развития.

Со временем Рейджи приобретает опыт и начинает лучше понимать, какую роль он играет в этом мире, а также как развитие “эмбриона” отражает его собственные черты и выборы. Сюжет подчеркивает связь между игровым процессом и личностным развитием, отмечая, что выборы и действия в мире Infinite Dendrogram формируют уникальный путь героя. Все происходящее сочетает в себе элементы приключений, столкновения с вызовами и драматических моментов, продиктованных и виртуальной средой, и реальной жизнью Рейджи.

Основным конфликтом остается необходимость выбора направления развития персонажа и способность адаптироваться к непредсказуемым ситуациям в игре, где стандартных решений нет. Финальное внимание сосредоточено на том, что для героя важны не только игровые достижения, но и процесс познания нового мира, который становится значимой частью его жизни, влияя на понимание себя и окружающей реальности.