Геноцид Онлайн — это произведение Такеноко, в котором действие происходит в альтернативной версии Японии. Главная героиня — японская принцесса, которая использует новую VRMMORPG как способ справиться с накопившимся стрессом. В игровом мире она выбирает роль антагониста и начинает менять окружающую реальность радикальными действиями. Вскоре после вступления в игру она превращает первый же город, с которым сталкивается, в территорию хаоса. Для достижения своих целей героиня уничтожает подпольную организацию, управляющую этим регионом, и даже устраивает государственный переворот в рамках игрового сюжета.

События фиксируются как дневник персонажа, известного в игровом мире и среди других игроков под прозвищами, которые отражают её жестокий и решительный характер: «геноцид-сан», «блуждающий последний босс» и другие. Основной конфликт разворачивается вокруг того, что главная героиня, действуя в образе злодея, сталкивается с сопротивлением различных фракций и с последствиями своих выборов, которые влияют как на виртуальный мир, так и на отношение к ней других игроков и НПС. Ей приходится принимать сложные решения, которые поддерживают или изменяют её позиции в игре и приводят к масштабным социальным и политическим изменениям. В центре внимания оказывается баланс между игровым процессом и влиянием поступков персонажа на разные стороны виртуального мира, а также непростая психологическая ситуация, в которой находится главная героиня, совмещая реальность и игру.