Облачные глаза Лилианы написанная Tenkai представляет собой сочетание приключений, комедии, фэнтези и повседневной жизни в стиле сёдзё. Главная героиня оказывается в необычной ситуации — после выхода из тоннеля она просыпается в полной темноте и осознаёт, что переродилась. При этом её пол изменился, а ожидаемых особых способностей, которые обычно даются при перерождении, у неё нет. Эта новая реальность ставит перед ней задачу разобраться в происходящем и понять своё место в этом мире.

Центральным конфликтом становится трудность принятия новых обстоятельств без привычных преимуществ и необходимость приспособиться к усложнившейся жизни. В ходе развития событий героине предстоит столкнуться с неопределённостью и внутренними сомнениями, что побуждает её искать способы справиться с возникающими вызовами. История сосредоточена на попытках героини понять свою ситуацию и найти своё место, несмотря на отсутствие особых сил и изменившиеся условия.