Сильнейший мракоборец Хогвартса повествует о взрослом мракоборце Исо Грине, который неожиданно оказывается в мире Гарри Поттера. Это опытный и циничный маг, прибывший из другого мира, обладающий не только магией, но и знаниями о будущем. Его цель — выжить в опасной среде, где границы между добром и злом чётко определены, и установить собственный порядок. Сюжет развивается вокруг борьбы Исо с различными угрозами, включая темных волшебников, а также сложные интриги Министерства Магии и скрытые планы Дамблдора.

Кроме того, на ситуацию влияет возвращение Того-Кого-Нельзя-Называть. Главный герой сталкивается с необходимостью принимать важные решения, влияющие на его положение и ход событий вокруг. Основной конфликт связан с противостоянием Исо мощным врагам и скрытым силам, которые стремятся контролировать или уничтожить его. Развитие событий отражает попытки героя сохранить свою независимость и изменить сложившийся порядок, используя свои уникальные способности и опыт.