Стальной алхимик и Бескрылый Ангел Макото Иноуэ и Хирому Аракава представляет собой произведение в жанрах драмы, приключений, стимпанка и фантастики. Главными героями являются братья Эдвард и Альфонс, которые направляются в столицу под названием Централ в сопровождении майора Армстронга. Их путешествие прерывается, когда поезд, на котором они едут, подвергается атаке террористов. В результате происшествия им приходится остановиться в небольшом городе Хисгард, где братья уже бывали ранее. В этом городе они встречают известного алхимика, входящего в число десяти наиболее уважаемых и талантливых в стране, а также его дочь.

Этот алхимик ведёт важное исследование, которое становится одним из значимых элементов сюжета. Развитие событий связано с необходимостью героев решить возникающие проблемы и преодолеть препятствия, связанные с нападением и новыми знакомствами. Основная напряжённость строится вокруг конфликта между героями и внешними угрозами, а также вокруг загадок и задач, связанных с исследованиями алхимика. Перед Эдвардом и Альфонсом стоят выборы, которые влияют на их дальнейший путь и способствуют развитию ключевых тем произведения.