Что охотится в тени разворачивается вокруг таинственного Калдриса, чье имя вызывает страх и уважение среди жителей Нотрека. Главная героиня оказывается связанной с ним и его тайными намерениями, которые остаются неизвестными и вызывают опасения. Вместе с Калдрисом и подкрепляемые Дикой Охотой — армией фейри-призраков, герои отправляются в деревню Мистфелл, где начинается действие, на границе между миром людей и миром фейри. В этом месте когда-то существовала магическая Завеса, отделяющая эти миры, и теперь героине предстоит столкнуться с последствиями магии, живущей в её крови.

По мере продвижения сюжета она должна разобраться в своей силе и истинной сущности, а также принять решение, связанное с её будущим и отношениями с Калдрисом. Основной конфликт строится вокруг неясных мотивов Калдриса, опасной магии и угрозы, которую она несёт, а также внутренней борьбы героини с неизведанными сторонами самой себя. Возникают сложные ситуации, требующие выбора и осознания границ между добром и злом в мире, где живут фейри и люди.