«День, когда я исчезла» Ким Харим рассказывает историю молодой женщины по имени Ёнён, которая после одиннадцатилетнего коматозного состояния приходит в себя в больничной палате. Она не помнит прошедшие годы и почти ничего не знает о событиях, связанных с ее прошлым, включая трагическую смерть своей младшей сестры Сугён, которая покончила жизнь самоубийством, бросившись с крыши школы. Последнее воспоминание Ёнён связано с падением с той же крыши и тенью, наблюдавшей за ней.

Главная героиня оказывается в одиночестве в чуждом и изменившемся мире, где ей приходится справляться с утратой семьи и собственными амнезийными пробелами. Отсутствие воспоминаний о месяце после смерти сестры становится главным препятствием для понимания произошедших событий. Уверенная в том, что смерть Сугён не была простым самоубийством, Ёнён берет на себя задачу раскрыть правду и найти виновного, поскольку считает, что сестру толкнули, а все ответы скрыты в забытых годах....