В поисках Принца сладостей рассказывает о Ноде Сагири, единственной девушке в клубе по каратэ, которая обладает мало выраженными женскими чертами. У нее есть необычный талант — она умеет прекрасно готовить сладости. Однажды, по своему настроению, она приносит в клуб печенье, сделанное своими руками. Когда один из популярных учеников школы, Мишель Франсуа, пробует эти сладости, он неожиданно заявляет, что хочет встретиться с той, кто их испекла. Это высказывание вызывает волну интереса и становится отправной точкой сюжета.

Начинается поиск загадочной девушки, которая создала печенье, но никто не предполагает, что это сама Сагири. Главная героиня оказывается втянутой в ситуацию, в которой ей приходится сохранять тайну своего увлечения и справляться с вниманием окружающих. Развитие событий связано с попытками понять, как себя вести в новом положении, как сохранить свой секрет и при этом не потерять связь с клубом и личной жизнью. Основной конфликт строится вокруг открытий и взаимодействий, которые следуют за этим неожиданным признанием. Сагири сталкивается с необходимостью выбирать между личной свободой и общественным вниманием к её способности, что влияет на её дальнейшие решения.